ТС излишне строго подходит к названиям советских кораблей. Ситуация конца 30-х и конца 40-х начала 50-х годов - это разные вещи.
Отношение к историческим личностям поменялось и очень сильно. Должен напомнить, что кодовое название операции Красной армии по освобождению Белоруссии как раз и было Багратион. Его именем после войны вполне могли назвать боевой корабль.
Что касается Микояна, то после войны он стремительно набирал политический вес и был членом Политбюро ЦК ВКПб. И авторитет у Микояна был побольше, чем у того же послевоенного Ворошилова.
На мой взгляд названия кораблям в игре, а точнее - нереализованным проектам этих кораблей, как раз дают с оглядкой на политические реалии того времени.