Судя по книге "Караван PQ17", в воду стреляли от отчания. Попадали, конечно же, но это скорее исключение, чем правило.
А так, если фантазировать, включить диванного теоретика, то:
есть возможность выставить замедление взрыва, чтобы он был не на броне, а за ней. Соответственно, взрывная волна может сбить торпеду с курса, повредить или даже уничтожить. Прямое попадание, опять же теоретически, не обязательно.